Прежде чем разбираться, почему групповые политики не применяются как ожидается, необходимо убедиться, что инфраструктура AD работает штатно. Работа ГП в домене зависит от корректности работы контроллеров домена и репликации между ними.
Следует держать структуру групповых политик как можно более простой и не создавать лишние политик без необходимости. Рекомендуется использовать единую схему именования политик. Имя ГП должно давать однозначное понимание того, для чего она нужна.