Диспетчер настроек находится в Меню запуска приложений в разделе Настройки. В диспетчере настроек объединены настройки различных компонентов Xfce. Они позволяют настроить Xfce под свои нужды. Все приложения, входящие в состав диспетчера настроек, сопровождаются руководством пользователя. Каждое руководство содержит назначение, возможности и способы использования программы. Руководство вызывается из меню Справка в запущенном приложении.

Настройка пользовательского интерфейса предполагает выбор его общего стиля из списка имеющихся в системе стилей, переопределение системного шрифта для всех элементов интерфейса (кроме заголовка окон, шрифт для которых определяется в модуле Диспетчер окон), выбор внешнего вида значков, настройки стиля отображения текста и значков рабочего стола.

Модуль Диспетчер окон содержит основные настройки поведения окон. С помощью этой настройки пользователь может изменять стиль и фокус окон, задавать разнообразные дополнительные опции поведения окон. Здесь же находятся настройки сочетания горячих клавиш.

Диспетчер окон (дополнительно) содержит дополнительные настройки поведения окон. В функции модуля входит: переключение окон, их размещение и их эффекты, настройка клавиши захвата окон и способы их перемещения, управление способами переключения рабочих мест.

В этом диалоговом окне можно настроить параметры отображения оповещений на вашем экране.

Настройка панели позволяет выбрать размер, внешний вид, стиль и расположение панели. Также позволяет добавлять или удалять панели с рабочего стола. В параметрах этой настройки пользователь может добавлять на панель новые, несущие различную по содержанию информацию, элементы.

В диалоговом окне предпочитаемых приложений можно задать веб-браузер, почтовую программу, файловый менеджер и эмулятор терминала, используемые по умолчанию.

Настройка рабочих мест позволяет задать, изменить количество рабочих мест и дать им собственные имена. Здесь же можно задать поля — области экрана, в которых невозможно размещать окна.

Настройка рабочего стола содержит определение его цвета и стиля, а также установку обоев. Можно отредактировать главное меню, закрепить вызов главного меню, список столов и открытых на них приложений за правой и средней кнопками мыши.

Файловый менеджер Thunar — одна из основных программ повседневного использования. Настройки файлового менеджера Thunar очень разнообразны. У него простой и интуитивный интерфейс, не содержащий бесполезных или вносящих путаницу элементов. Thunar быстро запускается, быстро открывает папки и быстро реагирует на действия пользователя.

Модуль параметров дисплея поддерживает RandR 1.2 — автоматически определяет дисплеи и позволяет пользователям выбирать предпочтительные разрешение, частоту обновления и ориентацию дисплея.

Модуль располагает настройками поведения клавиатуры. Эта функция позволяет задать режим настройки ввода и курсора, горячие клавиши для запуска приложений и раскладку клавиатуры.

Менеджер питания содержит общие параметры управления электропитанием. С помощью этого модуля пользователь может менять настройки DPMS.

Модуль Мышь и тачпад содержит настройки курсора и режим его работы (левша/правша), настройки параметров обратной связи (ускорение и порог) и параметров двойного щелчка (время и расстояние), содержит выбор темы курсора: его размер и изображение.

Данная функция позволяет настроить управление томами: накопителями, камерами, принтерами, устройствами ввода информации. Наличие в системе поддержки HAL и установки пакета thunar-volman-plugin расширяют возможности пользователя в использовании данной настройки.

Редактор типов MIME — программа, c помощью которой вы можете задавать разные приложения по умолчанию для открытия файлов разных форматов.

Данная функция позволяет настроить параметры запуска рабочего стола и заставки. С помощью этого компонента пользователь может настроить автозапуск предпочитаемых приложений.

Модуль специальных возможностей содержит настройки конфигурирования клавиатуры и мыши, настройки скорости срабатывания клавиш, чувствительность мыши и скорость повторного нажатия клавиш. С помощью этой настройки можно задать такие опции клавиатуры, как залипающие, медленные и повторяющиеся клавиши.

Редактор настроек — программа, которая позволяет изменять различные настройки каналов.

Новые инструменты Xfce находятся в постоянной разработке см. http://www.xfce.org/projects.