Moodle позволяет делать резервные копии курсов Администрирование → Курсы → Резервные копии. Вы можете назначить файлы и служебную информацию для резервирования. Также, можно выбрать автоматическое копирование через определённый промежуток времени.

Кроме этого, резервное копирование можно осуществлять через блок Настройки → Резервное копирование.