Ни для кого не секрет, что Linux является многопользовательской операционной системой — это значит, что она разработана в расчёте на одновременную работу нескольких пользователей. При этом всякая будничная работа под Linux, не являющаяся системным администрированием, может и должна выполняться непривилегированными пользователями. Этому правилу необходимо следовать для того, чтобы вероятность приведения системы в нерабочее состояние из-за вашей случайной ошибки или возможных ошибок в используемых вами программах была сведена к минимуму.
К сожалению, немалая часть программного обеспечения написана безграмотно с точки зрения безопасности. Запуская такие программы непривилегированным пользователем, вы тем самым автоматически уменьшаете риск повреждения системы от сбоя и усложняете процедуру вторжения в вашу систему потенциальных взломщиков.
В Master 2.2 настройки для пользователя root определяются спецификой его задач, а потому не приспособлены для повседневной работы и лишь ограниченно локализованы.