Диспетчер настроек можно запустить, нажав кнопку Все настройки в Меню запуска приложений, либо, выбрав пункт меню Диспетчер настроек в разделе Настройки. В диспетчере настроек объединены настройки различных компонентов Xfce. Они позволяют настроить Xfce под свои нужды.

Все приложения, входящие в состав диспетчера настроек, сопровождаются руководством пользователя. Каждое руководство содержит назначение, возможности и способы использования программы. Руководство вызывается из меню Справка в запущенном приложении.

Настройка пользовательского интерфейса предполагает выбор его общего стиля из списка имеющихся в системе стилей, переопределение системного шрифта для всех элементов интерфейса (кроме заголовка окон, шрифт для которых определяется в модуле Диспетчер окон), выбор внешнего вида значков, настройки стиля отображения текста и значков рабочего стола.

Модуль Диспетчер окон содержит основные настройки поведения окон. С помощью этой настройки пользователь может изменять стиль и фокус окон, задавать разнообразные дополнительные опции поведения окон. Здесь же находятся настройки сочетания горячих клавиш.

Диспетчер окон (дополнительно) содержит дополнительные настройки поведения окон. В функции модуля входит: переключение окон, их размещение и их эффекты, настройка клавиши захвата окон и способы их перемещения, управление способами переключения рабочих мест.

Clipman — менеджер буфера обмена срелы Xfce. Данный модуль позволяет изменить настройки Clipman: настроить поведение программы, параметры журнала, добавить дополнительные действия.

Файловый менеджер Thunar — одна из основных программ повседневного использования. Данный модуль позволяет изменить настройки файлового менеджера Thunar: режим просмотра папок, параметры отображения боковой панели, способ выбора и активации объектов.

Настройки терминала позволяют задать разделители окон или вкладок, выполнить настройку внешнего вида окна и вкладок терминала, настроить быстрые клавиши.

В этом диалоговом окне можно установить изображение и задать данные пользователя (имя, фамилия, телефон, электронная почта). В настоящее время LibreOffice и Pidgin могут работать с этими данными.

В этом диалоговом окне можно настроить параметры отображения оповещений на экране пользователя.

Настройка панели позволяет выбрать размер, внешний вид, стиль и расположение панели. Также позволяет добавлять или удалять панели с рабочего стола. В параметрах этой настройки пользователь может добавлять на панель новые, несущие различную по содержанию информацию, элементы.

Mousepad — текстовый редактор по умолчанию для среды XFCE. С помощью этой настройки можно установить отступы табуляции, включить отображение нумерации строк, непечатаемых символов, и подсветку строк, настроить окно программы.

Настройка рабочих мест позволяет задать, изменить количество рабочих мест и дать им собственные имена. Здесь же можно задать поля — области экрана, в которых невозможно размещать окна.

Настройка рабочего стола содержит определение его цвета и стиля, а также установку обоев. Здесь можно отредактировать главное меню, закрепить вызов главного меню, список столов и открытых на них приложений за правой и средней кнопками мыши.

Хранитель экрана (screensaver) — программа гашения экрана при простое компьютера, созданная для снижения непроизводительного износа оборудования, а также несущая энергосберегающие функции и функции безопасности, при условии присутствия в программе блокировки рабочей консоли паролем. В данном модуле можно включить/отключить хранитель экрана, выбрать тему заставки, установить время бездействия системы, по истечении которого будет активирована заставка, настроить блокировку экрана.

Модуль позволяет настроить подключение к стороннему устройству по Bluetooth.

Модуль параметров дисплея автоматически определяет дисплеи и позволяет пользователям выбирать предпочтительные разрешение, частоту обновления и ориентацию дисплея.

Модуль располагает настройками поведения клавиатуры. Эта функция позволяет задать режим настройки ввода и курсора, горячие клавиши для запуска приложений и раскладку клавиатуры.

Менеджер питания содержит общие параметры управления электропитанием. С помощью этого модуля пользователь может менять настройки DPMS.

Модуль Мышь и тачпад содержит настройки курсора и режим его работы (левша/правша), настройки параметров обратной связи (ускорение и порог) и параметров двойного щелчка (время и расстояние), содержит выбор темы курсора: его размер и изображение.

Данная функция позволяет настроить управление томами: накопителями, камерами, принтерами, устройствами ввода информации. Наличие в системе поддержки HAL и установки пакета thunar-volman-plugin расширяют возможности пользователя в использовании данной настройки.

Данная функция позволяет настроить цветовые профили для принтеров и сканеров.

В диалоговом окне предпочитаемых приложений можно задать веб-браузер, почтовую программу, файловый менеджер и эмулятор терминала, используемые по умолчанию. Здесь же можно задавать приложения по умолчанию для открытия файлов разных форматов.

Данная функция позволяет настроить параметры запуска рабочего стола и заставки. С помощью этого компонента пользователь может настроить автозапуск предпочитаемых приложений.

Модуль специальных возможностей содержит настройки конфигурирования клавиатуры и мыши, настройки скорости срабатывания клавиш, чувствительность мыши и скорость повторного нажатия клавиш. С помощью этой настройки можно задать такие опции клавиатуры, как залипающие, медленные и повторяющиеся клавиши.

Модуль позволяет просмотреть и изменить настройки конфигурации, хранящиеся в Xfconf.

Новые инструменты Xfce находятся в постоянной разработке см. http://www.xfce.org/projects.